O ministro André Mendonça foi o único integrante do Supremo Tribunal Federal (STF) a votar a favor de afastar Alexandre de Moraes e Flávio Dino do julgamento da denúncia contra Jair Bolsonaro e Braga Netto. O caso trata de uma suposta tentativa de golpe para impedir a posse do presidente Lula. Para Mendonça, Moraes deveria ser impedido por ter sido alvo da trama, e Dino, por já ter processado Bolsonaro antes de entrar na Corte.
Apesar do voto divergente, o STF formou maioria para rejeitar o pedido de impedimento, encerrando o julgamento com placar de 9 a 1. Mendonça foi o último a votar. A Corte entendeu que não há motivos jurídicos que invalidem a participação dos dois ministros na análise da denúncia apresentada pela Procuradoria-Geral da República.
Em relação ao ministro Cristiano Zanin, Mendonça votou com os demais colegas, mantendo a unanimidade (10 a 0) a favor de sua participação no julgamento. Ele defendeu que o fato de Zanin ter atuado como advogado da campanha de Lula em 2022 não compromete sua imparcialidade.
